MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Shigella boydii CDC 3083-94 chromosome

Total Repeats: 21560

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010658	TG	3	6	37	42	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_010658	A	7	7	47	53	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_010658	CAGA	2	8	156	163	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4	NC_010658	ACA	2	6	181	186	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_010658	A	6	6	274	279	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_010658	T	8	8	302	309	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_010658	AAC	2	6	329	334	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_010658	T	6	6	5070	5075	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_010658	AAC	2	6	5162	5167	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_010658	CGT	2	6	5168	5173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_010658	GCA	2	6	5290	5295	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_010658	TGG	2	6	5398	5403	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_010658	ACA	2	6	5406	5411	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_010658	CCG	2	6	5449	5454	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15	NC_010658	CCG	2	6	5458	5463	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16	NC_010658	CCA	2	6	5466	5471	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17	NC_010658	CTC	2	6	5480	5485	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18	NC_010658	ATC	2	6	5489	5494	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_010658	CGG	2	6	5496	5501	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_010658	AT	3	6	5612	5617	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_010658	CGC	2	6	5656	5661	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
22	NC_010658	A	7	7	6495	6501	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_010658	AAG	2	6	8018	8023	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_010658	TA	3	6	8024	8029	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_010658	GGCG	2	8	8086	8093	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
26	NC_010658	CGG	2	6	8150	8155	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_010658	CGT	2	6	8170	8175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_010658	ATC	2	6	8179	8184	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_010658	CTGT	2	8	9239	9246	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
30	NC_010658	C	6	6	9899	9904	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
31	NC_010658	G	6	6	9909	9914	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
32	NC_010658	ATC	3	9	10506	10514	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_010658	GAAT	2	8	10515	10522	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
34	NC_010658	AAT	2	6	10528	10533	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_010658	ATA	2	6	10569	10574	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_010658	GAAAAT	2	12	10612	10623	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_010658	T	6	6	12451	12456	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_010658	CTT	2	6	12476	12481	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_010658	GAG	2	6	12483	12488	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_010658	GGC	2	6	12546	12551	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_010658	AAC	2	6	12570	12575	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_010658	CGG	2	6	12584	12589	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_010658	CAG	2	6	12593	12598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_010658	CTTC	2	8	12604	12611	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
45	NC_010658	CTGG	2	8	12639	12646	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
46	NC_010658	CTG	2	6	12702	12707	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_010658	TG	3	6	12727	12732	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_010658	ATCA	2	8	12765	12772	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
49	NC_010658	GGC	2	6	12894	12899	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_010658	CAT	2	6	13633	13638	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_010658	CTG	2	6	13949	13954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_010658	AGA	2	6	13961	13966	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_010658	TCTTT	2	10	13980	13989	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
54	NC_010658	TTA	2	6	13990	13995	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_010658	T	6	6	13999	14004	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_010658	ATTC	2	8	14024	14031	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
57	NC_010658	A	6	6	14104	14109	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_010658	TGA	2	6	14127	14132	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_010658	TAG	2	6	14152	14157	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_010658	AGTG	2	8	14166	14173	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_010658	A	7	7	14181	14187	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_010658	ATG	2	6	14243	14248	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_010658	AT	3	6	14254	14259	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_010658	A	6	6	16273	16278	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_010658	CCG	2	6	17502	17507	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
66	NC_010658	GCC	2	6	17602	17607	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
67	NC_010658	CGG	2	6	17612	17617	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_010658	ATC	2	6	17644	17649	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_010658	TGC	2	6	17656	17661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_010658	CT	3	6	17669	17674	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
71	NC_010658	GACA	2	8	17796	17803	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
72	NC_010658	CGC	2	6	17816	17821	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
73	NC_010658	TAT	2	6	17822	17827	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_010658	CT	3	6	17832	17837	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
75	NC_010658	T	6	6	17898	17903	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_010658	ATT	2	6	17913	17918	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_010658	ATT	2	6	17945	17950	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_010658	GAC	2	6	17951	17956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_010658	ATT	2	6	17964	17969	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_010658	ATTA	2	8	18011	18018	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_010658	TAAT	2	8	18029	18036	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_010658	A	6	6	18153	18158	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_010658	ATT	2	6	18162	18167	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_010658	GAT	2	6	18192	18197	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_010658	GA	3	6	19471	19476	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
86	NC_010658	GGA	2	6	20409	20414	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
87	NC_010658	ATT	2	6	20455	20460	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_010658	ATT	2	6	20475	20480	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_010658	AATA	2	8	20499	20506	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_010658	CTTC	2	8	20521	20528	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
91	NC_010658	AGT	2	6	20546	20551	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_010658	CAT	2	6	20585	20590	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_010658	T	6	6	20644	20649	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_010658	ATG	2	6	20760	20765	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_010658	ATT	2	6	20781	20786	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_010658	CGG	2	6	23791	23796	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_010658	GCTG	2	8	23827	23834	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
98	NC_010658	GGA	2	6	23857	23862	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
99	NC_010658	GT	3	6	24308	24313	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
100	NC_010658	TC	3	6	24314	24319	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
101	NC_010658	CAT	2	6	24323	24328	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_010658	AGC	2	6	24332	24337	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_010658	A	7	7	24344	24350	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_010658	CTT	2	6	24722	24727	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_010658	CGC	2	6	29307	29312	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
106	NC_010658	AGC	2	6	30758	30763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_010658	T	6	6	30800	30805	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_010658	TCAT	2	8	31757	31764	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
109	NC_010658	TCCC	2	8	31787	31794	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
110	NC_010658	TGGC	2	8	31828	31835	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
111	NC_010658	ATTTA	2	10	32754	32763	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_010658	TA	3	6	32824	32829	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_010658	TCT	2	6	32853	32858	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_010658	TGT	2	6	32864	32869	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_010658	TCT	2	6	32929	32934	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_010658	TGC	2	6	32935	32940	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_010658	CATG	2	8	32997	33004	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
118	NC_010658	ATA	2	6	33014	33019	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_010658	A	6	6	33021	33026	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_010658	GCC	2	6	33069	33074	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
121	NC_010658	TCG	2	6	33088	33093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_010658	TCA	2	6	33119	33124	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_010658	AGTG	2	8	33147	33154	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
124	NC_010658	TGA	2	6	37624	37629	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_010658	T	8	8	37636	37643	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_010658	G	6	6	37664	37669	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
127	NC_010658	CAC	2	6	38327	38332	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
128	NC_010658	AGGA	2	8	38350	38357	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
129	NC_010658	ATGGAA	2	12	38364	38375	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_010658	CAT	2	6	38400	38405	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_010658	GCA	2	6	38425	38430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_010658	TGGCG	2	10	38467	38476	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
133	NC_010658	TTG	2	6	38525	38530	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134	NC_010658	ATC	2	6	38624	38629	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_010658	CGA	2	6	38652	38657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_010658	TGTT	2	8	38658	38665	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
137	NC_010658	CGC	2	6	38797	38802	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
138	NC_010658	ATG	2	6	38853	38858	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NC_010658	GGC	2	6	38864	38869	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_010658	GCG	2	6	38891	38896	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_010658	TGTT	2	8	38903	38910	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
142	NC_010658	TTA	2	6	38954	38959	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_010658	GAT	3	9	38989	38997	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
144	NC_010658	AGC	2	6	39033	39038	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
145	NC_010658	GCA	2	6	39040	39045	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
146	NC_010658	CGC	2	6	39071	39076	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
147	NC_010658	TGTT	2	8	39093	39100	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
148	NC_010658	GCC	2	6	39101	39106	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
149	NC_010658	TTG	2	6	39170	39175	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
150	NC_010658	GTG	2	6	39212	39217	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
151	NC_010658	CCG	2	6	39248	39253	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
152	NC_010658	TTG	2	6	39287	39292	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
153	NC_010658	ATG	2	6	39308	39313	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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155	NC_010658	CTGG	2	8	39358	39365	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
156	NC_010658	AAT	2	6	39529	39534	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
157	NC_010658	TTG	2	6	39586	39591	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
158	NC_010658	TC	3	6	39692	39697	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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160	NC_010658	AT	3	6	39735	39740	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
161	NC_010658	TGTT	2	8	42207	42214	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
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177	NC_010658	A	7	7	61128	61134	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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185	NC_010658	AAT	2	6	68418	68423	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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279	NC_010658	GCG	2	6	106831	106836	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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284	NC_010658	ACA	2	6	107020	107025	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
285	NC_010658	ATG	2	6	107083	107088	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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461	NC_010658	TGT	2	6	141411	141416	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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